农民就业培训专业设置可以在办学实践中逐步摸索、调整，形成各具特色的专业类型。一般而言，专业设置的类型包括单一型和复合型两种。
单一型专业是按照传统的专业划分方法确定的、专业指向明确单一的一类专业，一般可以通过两个视角进行划分：产业归属和专业特征。产业归属的视角是指专业设置可以以一、二、三产业为标准进行划分。具体而言，第一产业类专业可以主要包含种植类专业和养殖类专业两大部分。种植类专业中有农学、农机、果树、蔬菜、花卉、食用菌等。养殖类专业有畜牧、兽医、水产、经济动物饲养等。第二产业类专业一般可以与当地的乡镇企业工种形成对应关系；对于靠近大城市的农村将受到城市机械、电子、纺织等主干工业的辐射，应对其予以设置；对于山区、渔岛等地区专业设置应以开发利用本地资源为重点；有采矿业、采石业、农林牧渔加工业、水产加工业、捕捞业等地区应突出其特点；有些地区应以继承民间传统工艺技术为重点，设置与印染业、刺绣业、编织业、酿造业、制革业等相关的专业。第三产业类专业要适应当地经济发展和外出务工的需要，设置财会、服装、幼师、工艺美术、理发技术等专业。专业特征的视角是按照各专业的特点进行专业设置。一是生产技术型专业，包括农学、蔬菜、畜牧等专业。这类专业为农、林、牧业培养初级实用技术人才，需在生产劳动中学习专业知识、生产技术，专业具有一定的知识性、技术性，具有较强的实践性和劳作性。二是手工操作性专业，包括专业缝纫、理发、木工、土建、石雕、扎染等专业。这类专业的手工操作性、手工技巧性较强，对文化基础要求不高，涉及的技术原理也较简单，主要是通过大量的操作实践来学习和掌握技艺。三是知识技能型专业，包括家电维修、农机修理、兽医等专业。这类专业所接触的工作对象、原理相对复杂，其专业技能是知识与经济紧密结合的产物，对文化基础要求稍高，需理论知识与操作实践有机协同，方能获得相应的技能。
复合型专业包括综合式专业、拼盘式专业和主辅式专业三种。综合式专业指相近专业群综合构建、有机组合而形成的综合性专业。由于目前农业生产力水平较低，分工分类不可能太细，农户大多是以一业为主，兼搞多种经营。因此，专业设置应逐步向综合化、群集式方向发展。拼盘式专业指一组相互联系不甚密切的专项技术，因某种特定原因（地方生产特色、家庭经营需求等），拼积在一起而形成的专业模式。如广西灵山县职业初中建立起的多种栽培（种植）技术并存且兼及养殖技术的拼盘式专业，体现了鲜明的地方性、针对性和实用性。主辅式专业指以某一单一型专业为主，辅以1-2门单项技术而构建的专业模式。如种植专业的课程设置中，为了拓展专业覆盖面，拓宽就业门路，可增设《家用电器初级维修技术》和《简易服装裁制技术》等课程。主辅式专业在农村经济相对发达，乡镇企业发展较快的地区，有着良好的实践效应。